A escola foi criada em 1979, período em que a Estufa se tornou um bairro populoso, acompanhando o surto de desenvolvimento ocorrido na época na cidade de Ubatuba.
Foi ocupado um terreno da Prefeitura, onde a Escola Sueli se instalou juntamente com a E.E. Profª Aurelina Ferreira. Eram utilizados também dois barracões pertencentes à capela vizinha.
As duas escolas funcionaram juntas até o ano de 1982, quando ficou pronto o prédio da Escola Aurelina.
A Escola funcionava em três turnos (manhã, tarde e noturno), abrangendo as 8ªs séries do Ensino Fundamental. A educação de jovens e adultos foi implantada apenas no ano de 1985.
No ano de 1989 ficou pronto o prédio novo, tendo ocorrido a mudança. No antigo prédio foi instalada uma Escola Municipal de Educação Infantil. O novo prédio nunca foi inaugurado oficialmente.
Na reorganização, as quatro primeiras séries do Ensino Fundamental foram destinadas à E. E. Profª Altimira Silva Abirached, tendo ocorrido também a implantação do período noturno.
Há alguns anos já se tornou uma tradição na escola o bom desempenho nos Jogos Escolares da Semana da Pátria. Embora seja uma escola pequena, a Sueli é respeitada no campo do esporte.
Algumas pessoas marcaram fortemente a história da escola, entre elas a Profª Rosa, diretora durante quase 10 anos, e sua assistente, Profª Arly Lacerda.
As informações desse histórico foram cedidas por duas figuras também importantes: Neusa de Oliveira, Secretária de Escola até o ano de 1994, e Mercedes Magalhães (Dona Nena), funcionária, vizinha e voluntária da Escola.
